Návrh nařízení vlády stanoví kritéria splnění podmínek pro zápis výzkumné organizace do seznamu a způsob jejich prokazování, podmínky pro změnu v zápisu a výmaz ze seznamu, obsah sbírky listin a způsob vykazování příjmů z transferu znalostí výzkumných organizací zapsaných na seznamu.
Předkládací zpráva kromě jiného konstatuje, že novela zákona č. 130/2002 Sb., která byla provedena zákonem č. 194/2016 Sb., nemá žádný vztah k existujícímu seznamu výzkumných organizací, který v současné době vede Rada vlády pro výzkum, vývoj a inovace (RVVI). Výzkumné organizace zapsané do existujícího seznamu budou muset zažádat o zápis do seznamu výzkumných organizací znovu.
Dále předkládací zpráva předpokládá určitou administrativní zátěž na straně výzkumných organizací v souvislosti s jejich zápisem do seznamu. Dále konstatuje, že samotný zápis do seznamu není podmínkou pro získání podpory, ale ani nepředstavuje jistotu získání podpory.
Zápisy, změny a výmazy ze seznamu výzkumných organizací budou prováděny v režimu správního řízení a budou bezplatné.
Z vlastního textu navrhovaného nařízení vlády vybíráme například to, že „žadatel v řízení o zápisu do seznamu prokazuje, že vede oddělené účetnictví pro financování, náklady a příjmy hospodářských činností, jsou-li vykonávány a žadatel k nim využívá stejné vstupy, a to dokumenty, ze kterých vyplývá náležité rozdělení financování nákladů a příjmů na hospodářské a nehospodářské činnosti“.
Dále se stanovuje, že „výzkumná organizace zapsaná v seznamu vykazuje příjmy z transferu znalostí a způsob jejich užití za předchozí kalendářní rok na formuláři uvedeném v příloze.“