Jan Hrušák aktuálně působí jako delegát ČR do ESFRI a současně jako člen jeho výkonného výboru a místopředseda ESFRI. Do funkce předsedy jej na období dvou let s možností prodloužení o jeden rok zvolilo 65. plenární zasedání ESFRI.
ESFRI bylo založeno roku 2002 z Rozhodnutí Rady EU pro konkurenceschopnost, která usiluje o růst a schopnost prosadit se ve výzkumu a inovacích v mezinárodním kontextu. ESFRI sdružuje členské státy Evropské unie a definuje priority pro výstavbu výzkumných infrastruktur panevropského charakteru. Jedná se o síť excelentních výzkumných center, které umožňují průlomové poznatky v základním a aplikovaném výzkumu. České instituce jsou zahrnuty například ve výzkumných infrastrukturách JHR, ELI, CESSDA, ACTRIS, INFRAFRONTIER nebo EURO-BIOIMAGING.
Pravidelně ESFRI zpracovává tzv. „ESFRI Roadmap“. Její poslední aktualizace probíhá letos a bude oficiálně představena dne 11. září 2018, a to pod záštitou rakouského předsednictví v Radě EU během „ESFRI Roadmap Launch Event“ a na konferenci „ICRI 2018“.
Jan Hrušák působí jako výzkumný pracovník Ústavu fyzikální chemie J. Heyrovského AV ČR a současně jako odborný konzultant Akademické rady Akademie věd ČR. Je dále členem i řady odborných orgánů zabývajících se tvorbou politiky výzkumu, vývoje a inovací, a to jak na národní úrovni ČR, tak v rámci Evropského výzkumného prostoru.
V roce 2015 byl Hrušák hlavním odborným konzultantem Ministerstva školství, mládeže a tělovýchovy během procesu přípravy Cestovní mapy ČR velkých výzkumných infrastruktur pro léta 2016 až 2022. V poslední době vedl mj. strategickou pracovní skupinu ESFRI zaměřenou na dlouhodobou udržitelnost výzkumných infrastruktur. Výstupem její činnosti se stala publikace „Long-Term Sustainability of Research Infrastructures“.
